Программирование

Тиаго Антао. Биоинформатика с Python. Книга рецептов

Биоинформатика с Python. Книга рецептов

Современные библиотеки и приложения Python для решения реальных задач вычислительной биологии

Биоинформатика — активная область исследований, в которой используется ряд простых и сложных вычислений для извлечения ценной информации из биологических данных. Из книги вы узнаете, как управлять этими задачами с помощью языка Python. Вы рассмотрите ключевые методы секвенирования нового поколения, анализа отдельных клеток, геномики, метагеномики, а также узнаете, как применяются алгоритмы машинного обучения в биоинформатике. Книга предназначена для аналитиков в области биоинформатики, специалистов по данным, вычислительных биологов, исследователей и разработчиков Python. Для изучения материала желателен опыт работы на Python и базовые знания в области биологии.

Одной из самых сильных сторон Python является обилие высококачественных научных библиотек и библиотек для обработки данных. В основе всех них лежит NumPy, который обеспечивает эффективную поддержку массивов и матриц. В дополнениях NumPy мы можем найти почти все научные библиотеки. Например, в нашей сфере есть Biopython. Но в нашей области можно использовать и другие общие библиотеки анализа данных. Так, Pandas является стандартом де-факто для обработки табличных данных. Совсем недавно библиотека Apache Arrow дала эффективную реализацию некоторых функций Pandas, а также совместимость языков. Наконец, Matplotlib является наиболее распространенной библиотекой для построения диаграмм в пространстве Python и подходит для научных вычислений. Хотя это общие библиотеки с широким применением, они имеют фундаментальное значение для обработки данных в биоинформатике, поэтому мы и будем их изучать.

Издательство: ДМК Пресс
Год: 2023
Страниц: 345
Язык: русский
Формат: pdf

 

Скачать книгу (19,9 МБ):

brij 28/05/23 Просмотров: 571
0